I en naturlig videnskaber akademisk program, kan mange grene af feltet udforskes i dybden med det mål at observere og lære om naturen. Nogle af disse grene kan omfatte astronomi, biologi, fysik, økologi og kemi.

Der er flere institutioner for videregående uddannelse placeret overalt Puerto Rico, med University of Puerto Rico er den ældste og største. Som område i USA, kan borgerne få adgang til yderligere muligheder for uddannelse.